کشت مدفوع روشی است برای تشخیص عوامل بیماریزا مانند باکتریها، ویروسها، قارچها، یا انگلها در نمونه مدفوع. این آزمایش برای تشخیص عفونتهای دستگاه گوارش و همچنین علائم دیگری مانند علائم گاستروانتریت، اسهال مزمن و خونی، درد شکمی مداوم و برخی مشکلات دیگر انجام میشود.